Den Tjekkiske Republik ser betydelige variationer i sæsonmæssige temperaturer på hele sit område, og en stor del af dens naturlige områder er beskyttet. De beskyttende og konservative foranstaltninger er dog ikke nok til at beskytte landets allerede skrøbelige økosystemer. Med den omfattende logning, især den store skarphed, skovrydning og ukorrekt arealanvendelse, er de økologiske regioner i Tjekkiet truet af eksistensen af menneskelige aktiviteter i området. Ulovlig skovhugst finder også sted i beskyttede områder, og snart vil store skovdækningsområder blive efterladt uden den naturlige vegetation. Mangel på indfødt planteliv har også ført til manglen på endemisk biodiversitet hos nogle økegrupper. World Wide Fund for Nature opdeler Tjekkiet i fire økologiske regioner, de centraleuropæiske blandede skove, de panniske blandede skove, de vestlige europæiske bredbladskove og de karperiske skovar i Karpaterne.
5. Karpatiske Montane Conifer Skove-
Karpaterne løber fra den vestlige grænse i Tjekkiet helt til "Iron Gate" i Donau-floden, der ligger mellem Rumænien og Jugoslavien, hvor floden tager en form op, der ligner en bueskytterbue. Det højeste punkt i Karpaterne er Tatraerne, som ligger på grænsen til Polen og Slovakiet. Skoven giver habitater til store populationer af brun bjørn, lynx og ulv, og udgør også det sidste hjem for den vilde kat og hakker for den gyldne ørn. Fjeldene i bjergene fodrer floderne i regionen. Klimaet i dette økosystem er moderat koldt og fugtigt, og både temperatur og nedbør korrelerer med højde. De nordlige dele består af karpatisk flysch, der består af sandsten og skiferlag. Krystallinsk sten, hovedsagelig granitten, udgør de højeste bjergkæder i Tatraerne, Paring og Retezat. De vestlige karpaterne har kalkstenbjerget. Omkring 16% af økosystemet er under nogen form for beskyttelse, men ulovlig logning, jagt og udvikling truer økosystemet.
4. Centraleuropæiske blandede skove
De centraleuropæiske blandede skove er et økosystem af blandede bredbladede og nåletræskove beliggende på lavlandet i Nord-Europa, der strækker sig over Tjekkiet, Ukraine, Hviderusland, Polen og Litauen. De blandede skove er et terræn af store sletter i midten, højlandet sydlige og bakkede morainer med søer mod nord. Størstedelen af regionen ligger under 300 meter over havets overflade med det højeste punkt, der ikke overstiger 600 meter. De gennemsnitlige årlige temperaturer spænder fra mellem 7 grader Celsius og 9 grader Celsius, og klimaet er mildt i vest og kontinentale i øst. Tidligere ister har resulteret i mangel på endemiske floraarter. Der er dog mange borealplanter, herunder cloudberry, dværgbirk begrænset til de nordlige dele af økregionen. Termophilus plantearter endemiske til varmere og tørre vaner vokser i de sydøstlige dele af bjergene og også i de åbne og semi-åbne levesteder dannet gennem menneskelige aktiviteter som græsning og brændende pensel. Arter af europæisk hare falder hurtigt som følge af jordmisbrug. Den hvide tailed ørnen (Haliaeetus albicilla) og plettet ørn (Aquila clanga) bor i disse blandede skove. Truede arter omfatter europæisk bison (Bison Bonasus), Los (Lynx lynx) den sorte grouse (Tetrao urogallus), dam kat (Myotis dasycneme), og steppe polecat steppe (Mustela eversmannii). Ca. 75% af det centraleuropæiske er beplantede skove. Afløb for skotsk fyr og gran er almindelig i Tjekkiet.
3. Pannonian Mixed Forests-
De Pannonian Mixed Forests tilhører biomaterialet Temperat Broadleaf og Mixed Forests. Skovene ligger i en depression omgivet af de Dinariske Bjerge, Karpaterne og Alperne. Den bjergrige region, der omgiver Pannonianen, forårsager en regnskygge over de panniske blandeskove, der tillader lidt nedbør for at nå det centrale område i økegionen. Meget af de naturlige levesteder, plante- og dyrearter er gået tabt i landbruget. Nogle af de dominerende træer omfatter kalkun eg, sessile eg og skovkulde eg. Der er også blandede eg-hornbjælke skove, bøg interspersed med stepper, poppel og floodplain vegetation. Regionen har en varm tempereret og somre er også varme. Indbyggede pattedyr omfatter ulv (Canis lupus), Europæisk kanin (Oryctolagus cuniculus), den truede europæiske mink (Mustela lutreola) og reptiler som Balkan Wall Lizard og Orsini Viper. Terrænet består hovedsagelig af mange floder, vandløb og søer.
2. Vesteuropæiske Broadleaf Forests-
De vestlige europæiske Broadleaf skove hører til den tempererede bredbladet og blandede skove biom. Biomet dækker store områder i Vesteuropa i Tjekkiet, Østrig, Tyskland, Schweiz og Frankrig. Det består primært af lavland, alti-montane bøg og de blandede bøgeskove og nogle dele af sub-Middelhavet, meso-supra-Middelhavet neddybende egetræskove og blandede eg-hornbeam skove. Økegionen støtter et bredt udvalg af dyr, især fuglearter og nogle pattedyr.
1. Miljømæssige trusler og bevarelsesindsats-
Nuværende trusler mod levesteder og biodiversitet i Den Tjekkiske Republik omfatter vand- og luftforurening, omfattende skovhugst, udvikling af store skisportssteder, turisme, jordkomprimering og skrotning. Rydning af skove til landbruget forårsager tab af levnedsmidler, der sætter planter og dyr i fare. Desforestation truer også biodiversiteten af disse skove, især i Karpaterne, og den hurtige nedlæggelse af traditionelle former for landbrug. Der opstår alvorlige fragmenteringer af regionerne, når motorveje og flerkanals jernbaner skaber hindringer for dyrelivsbevægelsen. På europæisk plan har kun 6.3% af skovene beskyttet status. 95% af de europæiske beskyttede skove er fragmenter, der besidder et lille område på højst ti kvadratkilometer. Også, 16% af Karpaterne nyder beskyttelse fra de medlemslande, den dækker. Den Tjekkiske Union for Naturbeskyttelse bringer også personer ind for at beskytte naturbeskyttelse og miljøproblemer sammen.
