Japan er velsignet med rig natur, der afspejler sin historie. Dens geologiske historie har givet den en ekstraordinær flora og fauna. Japan har en forskelligartet levested, der understøtter rige dyrearter. Over 80,000 dyrearter er blevet bekræftet i Japan. De fleste af dyrearterne er uerstattelige og har udviklet sig gennem årene og dannet et unikt økosystem ved at interagere med hinanden. Der er omkring 153 arter af pattedyr i landet, hvoraf 3 er kritisk truet, 22 er truet, og 13 arter er kategoriseret som sårbare. Nedenfor er nogle af de dyr, der er hjemmehørende i Japan.
10. Red-Crowned Crane
Den rødkronede kran er en stor kran, der kendes som et symbol på held og lang levetid i nogle dele af verden. Den japanske kran er blandt de sjældneste østasiatiske kraner. Deres navn stammer fra plettet af rød, blonder på kronen, der bliver lysere i ynglesæsonen. Den rødkronede kran er snehvide i farve med sort på de nederste dele af vingerne. Hanner har også sorte kinder, hals og hals, mens hunnerne er grå i disse pletter. Kranerne findes i Hokkaido og er for det meste ikke-migrerende. De er omnivorer og fodrer med ris, gulerødder og vandplanter.
9. Ussuri Black Bear
Ussuri sorte bjørn er den største asiatiske sortbjørn underarter. Det er indfødt i fjernøsten, herunder den koreanske halvø. Ussuri sorte bjørn er opkaldt efter Ussuri-floden, der løber gennem Rusland og Kina. Den har hvid eller creme "moon" krave, der er almindelig på asiatisk sort bjørn, men har større ører sammenlignet med andre arter. Mandbjørn vejer ca. 200 kg, mens kvinden vejer 140 kg. Ussuri sorte bjørne bruger de fleste af deres vintre i huler og er hovedsagelig natlige. Bjørnen er omnivorøs, men overvejende herbivorøs, fodring på græs, nødder og termitter.
8. Stellar's Sea Lion
Stellars hav løve er en slags løve, der er kategoriseret som nært truet. Det er den største af eared seal men underordnet i størrelse blandt pinnipeds. Deres seneste betydelige, uforklarlige tilbagegang har tiltrukket betydelig opmærksomhed. Adult Stellars søløver er lettere end de fleste søløver. Dens farve spænder fra lysegul til tyg og undertiden rødlig. Mænd kan skelnes fra kvinden ved højere pande og grovere hår omkring halsen. Søløverne lever i kystfarvande på grund af det kølige tempererede klima. De er hovedsagelig kødædende, men kan falde i bytte for at dræbe hvaler.
7. Japansk Pond Turtle
Den japanske damskildpadde er en slags skildpadde, der tilhører familien Geoemydidae. Det er endemisk til Japan og er lokalt kendt som "Nihon ishigame". Dens befolkning er signifikant faldet i de sidste to årtier, hovedsageligt på grund af tab af habitat. Men det er endnu ikke erklæret truet. Skildpadden har en gulbrun karapacet og olivenbrunt hoved. Kvinden er større end hanen og kan vokse op til 21 centimeter lang. Men mænd har længere haler. Kosten af en japansk dam skildpadde er varieret og omfatter frøer, vand insekter, tadpoles og regnorme.
6. Grøn fasan
Den grønne fasan er endemisk og indfødt til den japanske øhav og den nationale fugl i Japan. Det findes hovedsagelig i Honshu, Kyushu og Shikoku. Fuglen er spredt over hele rækken og kan altid ses på landbrugsarealer og menneskelige bosættelser. Den mandlige grønne fasan har grøn fjerning på bryst og flanker, mens kvinden har brunlig sort fjerdragt. Hannerne er lidt større end kvinden. I Japan får de med jagtlicenser lov til at jage fuglen. De kan fange højst to hanfugle om dagen. Dog er det ikke tilladt at skyde en kvindelig fugl.
5. Japansk kæmpe salamander
Den japanske gigantiske salamander er endemisk til Japan og findes på tværs af det sydvestlige Japan. En voksen salamander kan vokse til ca. 5 fødder lang og veje 55 pounds. Japansk gigantisk salamander er den næststørste amfibie i verden. Den har en brun og sort smeltet hud, der hjælper med at camouflere mod flodbund. Øjnene er små og har ingen øjenlåg, mens munden løber over hovedets bredde. Japansk gigantisk salamander beskytter sig mod rovdyr ved at frigive en stærk duftende mælkeagtig substans. Dens kost består af insekter, fisk og frøer.
4. Sika Hjorte
Sika hjorten er en hjorte art indfødt til dele af Østasien og også introduceret i nogle dele af verden. Arten er overbevisende i Japan. Navnet "Sika" kommer fra det japanske ord "Shika", hvilket betyder hjorte. Sika hjorten er blandt de få arter af hjorte, der ikke er pletter på at nå modenhed. Nogle arter har store pletter, mens andre har næsten usynlige pletter. Pelagefarven spænder fra mahogny til sort. Frakken mørkner om vinteren. Det foder hovedsageligt i løbet af dagen i klumpede clearings i skoven.
3. Japansk Macaque
Den japanske macaque er en art terrestrisk abe. Det hedder også "sneaben", fordi det befinder sig i områder, hvor sneen dækker de dyrkede i nogle måneder af året. Apen er seksuelt dimorf med mændene vejer omkring 11 kg, mens hannerne vejer 8 kg. Det har et rosa ansigt og posterior med resten af kroppen dækket af gråt hår. Frakken er tilpasset til det kolde område, idet tykkelsen øges efterhånden som temperaturen falder. Den japanske makak er allnærende spisende sorter af fødevarer, herunder 213 arter af planter, insekter og jord.
2. Dugong
Dugong er et havpattedyr og en af de levende arter af familien Dugongidae. Det er det eneste strengt marine herbivorøse pattedyr. Dugong har en stor krop med cylindrisk form, der tapper begge ender. Huden er tyk og glat og har lys farve ved fødslen og mørkere med alderen. Kroppen har sparsomt hår, som hovedsagelig er udviklet rundt om munden. Halen flukes og flippers ligner dem af en delfin. Dugongs er almindelige i varme kystfarvande. Det henvises til "sea cow", fordi dens kost består af havgræs. Dugong indtager hele planten, herunder roden.
1. Amami kanin
Amami kaninen er en kanin, der almindeligvis findes i Amani Oshima og Toku-no-Shima i Japan. Det er en overlevende rest af de gamle kaniner, der engang beboede det asiatiske fastland. Kaninen har korte fødder og bagben. Dens krop er omfangsrig og dækket af tyk, uldig, mørkbrun pelage. Forefæet har stærke og næsten lige klør, mens de på bagbenene er buede. Amami kaninens kost består af over 29 plantearter, herunder buske og urteplanter.