En biodiversitet hotspot er et område, der er vært for en usædvanlig mangfoldighed af flora og fauna, herunder mange endemiske arter, der er truet af ødelæggelse af levesteder og andre menneskeskabte pres. Sydøstasien og Asien-Stillehavsområdet er vært for ni biodiversitets hotspots. Denne region består hovedsagelig af øer og arkipelagoer i Stillehavet. På grund af geografisk isolation har flora og fauna i de fleste af øerne i denne region udviklet sig selvstændigt, hvilket fører til de høje niveauer af endemisme, der ses her. Men med ankomsten af mennesker på disse øer har det oprindelige dyreliv lidt meget. Indførte arter af både planter og dyr har negativt påvirket overlevelsen af de endemiske arter på disse øer. Biodiversitet hotspots i denne region kræver høj beskyttelsesniveau for at sikre overlevelse af dyrelivet, der findes her.
Østlige melanesiske øer
Denne biogeografiske region er beliggende i Oceanien er Melanesia-regionen. Hotspotet omfatter omkring 1,600 øer mod øst og nordøst for øen New Guinea, der omfatter et område på omkring 100,000 kvadratkilometer. Seks økegrupper er en del af dette hotspot. Tropiske regnskove dækker store områder af området i dette hotspot. Om 8,000 vaskulære plantearter findes her, herunder 3,000 endemiske arter. 360 fuglearter, hvoraf 40% er endemiske, bor også her. Næsten 50% af 85-arterne af pattedyr fra de østlige melanesiske øer findes ikke andetsteds i verden. Flagermus har den største mangfoldighed blandt de pattedyr, der findes her. Den reptiliske, fisk, amfibie og hvirvelløse mangfoldighed i regionen er også bemærkelsesværdige.
Ny Kaledonien
Ny Kaledoniens biodiversitet er en af de rigeste i verden. Denne biodiversitet hotspot har en række forskellige levesteder, herunder koralrev, atoller og øer i forskellige størrelser. Høje niveauer af endemisme kan ses i de arter, der befinder sig på øerne Ny Kaledonien. 22 endemiske arter af jordfugle som den nye caledonian kråke, laurbær skovdue, new caledonian parakeet og andre findes her. Seks endemiske arter af flagermus er de eneste oprindelige pattedyr, der findes her. Verdens højeste biodiversitet af Volutomitridae findes i offshore-farvande i Ny Kaledonien. Der forekommer også flere endemiske reptilarter. Skovrydning og invasive arter er de største trusler mod vilde dyr i Ny Kaledonien.
New Zealand
New Zealand, et øland i Stillehavet, er vært for en utrolig biodiversitet og et stort antal endemiske arter på grund af dets relative isolation i havet. Arter her har udviklet sig selv i millioner af år for at producere flora og fauna fundet ingen andre steder i verden. 80% af alle vaskulære planter, der findes i New Zealand, er endemiske til landet. Alle krybdyr, amfibier og flagermus, der findes her, er også endemiske. Næsten 70% af fuglene i New Zealand, 90% af ferskvandsfiskarter og 90% af insekter og bløddyr er også specifikke for New Zealandernes øer. Mauiens delfin og Hectors delfin er to cetacean-underarter, der også findes kun i New Zealand's offshore farvande.
Filippinerne
Den suveræne nation i Filippinerne har omkring 7,641 øer og er en af verdens bedste pletter af biodiversitet og endemisme. Øgruppen indtager et område på omkring 300,780 kvadratkilometer. Landet er vært for 1,100 arter af jordlevende hvirveldyr, som omfatter 100 pattedyr og 170 fuglearter, der findes ingen steder i verden. 16 nye pattedyrarter er blevet opdaget her i det sidste årti. Regnskoven er her en rig mangfoldighed af flora, herunder Rafflesia og sjældne orkideer. Pythoner, kobraer og massive saltvandskrokodiller findes her. Den filippinske tarsier, filippinske ørn, skyrotterne er nogle af de endemiske arter, der findes her. Afskovning på grund af ulovlig skovhugst er en stor trussel mod regionens dyreliv. Skovdæk her er faldet fra 70% til kun omkring 18.3% mellem 1990 og 1999. Ifølge forskerne udsættes arten her for en katastrofal udryddelsesrate på 20% ved udgangen af det nuværende århundrede.
Polynesien-Mikronesien
Denne biodiversitet hotspot omfatter alle øer Polynesien og Micronesia i Stillehavet samt øerne Fiji. Dette hotspot spredes således over en massiv, herunder 11-nationer, 8-territorier og endda Hawaii. Det samlede areal i dette hotspot er dog kun omkring størrelsen af Schweiz. En bred vifte af økosystemer findes her som vådområder, regnskove, græsarealer mv. Disse indlands indfødte flora og fauna er stærkt truet af habitattab og invasive arter.
Østlige australske tempererede skove
Dette biodiversitet hotspot strækker sig langs Stillehavets kyst fra lige syd for Sydney til de nordlige dele af byen Cairns. Ligesom andre hotspots er kystskoven i denne region hjemsted for en stor mangfoldighed af flora og fauna, herunder mange, der ikke findes andre steder. På mange områder i dette hotspot er indfødte vegetationer blevet ryddet ud for at skabe plads til menneskelige bosættelser og økonomiske aktiviteter. Således er beskyttelsen af skovene her her behovet for dagen.
Sydvestlige australien
Denne biodiversitet hotspot indtager et område på omkring 356,700 kvadratkilometer i Australiens sydvestlige tip. Regionen har forskellige typer af levesteder, herunder skov-, busk-, skov- og hedevegetation. Nogle af de endemiske arter, der findes her, omfatter den røde papegøje, truet numbat, honning possum, western sump skildpadde og andre.
Sundaland og Nicobar-øerne i Indien
Denne biodiversitet hotspot omfatter Sundaland, en sydøstasiatisk biogeografisk region og Nicobar Islands skærgård i Indien i Det Indiske Ocean. Regionen er vært for et imponerende antal endemiske flora og fauna. Der er varierede økosystemer i regionen som montane og lavland regnskove, sumpskove, græsarealer og buskmarker, enge og endda mangrove. Nær 60% af de tusindvis af vaskulære plantearter, der findes her, er endemiske for regionen. Komodo drager, proboscis aber, sumatran tigre, orangutaner, gris-tailed langurs osv. Er nogle af de fauna, der findes her.
Wallacea
Denne biodiversitet hotspot omfatter en gruppe indonesiske øer mellem australske og asiatiske kontinentale hylder. Nogle af de store øer, der findes her, omfatter Sulawesi, Lombok, Flores, Timor, osv. Wallaceas flora og fauna udviser et højt niveau af øendemisme. Da øerne i regionen er adskilt fra hinanden ved dybt vand, er den specifikke mangfoldighed mellem disse øer også meget vigtig. Nogle af de endemiske arter omfatter anoa eller dværgbøffel og babirusa eller hjorte svin. Øen Seram er berømt for sit fugleliv, herunder den noterede Amboina King Papegøje. Wallacea er også vært for en stor mangfoldighed af levesteder som mangrover, montane skove, tropiske fugtige bredbladede skove osv.
