Times Higher Education rangerede Tokyo-universitetet som Japans førende universitet i 2015-2016. Japan har mere end 780 universiteter og mange gymnasier, herunder en række specialiserede gymnasier. Landets universiteter er særligt berømte inden for medicin, videnskab, teknologi og forskning.
5. Osaka University -
Osaka University ligger i Osaka, Japan, og det er landets sjette ældste universitet. Skolen har tre hovedområder, nemlig Minoh, Suita og Toyonaka, der spredes ud i Osaka City. Universitetet blev oprettet i 1931 med integrationen af College of Science og Osaka Prefectural Medical College. Universitetet er hjemsted for 7,856 postgraduate studerende og 15,937 undergraduates. Skolen tilbyder kvalitetsuddannelse inden for medicin, videnskab, lov og teknologi. Noterbare alumner omfatter økonomerne Heizo Takenaka og Michio Morishima.
4. Tokyo Institute of Technology -
Tokyo Institute of Technology er centreret i Tokyo, Japan. Institutionen har også satellitcampuser spredt ud over Ōokayma, Tamachi og Suzukakedai. I året 2015-2016 indrømmede skolen 4,734-studerende til bacheloruddannelser og 1,464-kandidater. Instituttet startede aktiviteter i 1881 som Tokyo Vocational School. Skolens programmer omfatter fremmedsprog, teknik, computer, videnskab, teknologi og kunst. Noterbare alumner omfatter Naoto Kan, som var Japans premierminister mellem 2010 og 2011, og arkitekten Hiroshi Takahashi.
3. Tohoku Universitet -
Tohoku Universitet ligger i Sendai, Miyagi præfektur i Tohoku-regionen i Japan. Skolen åbnede sine døre i 1907 som Japans tredje kejserlige universitet. Det blev etableret som Japan omfavnede modernisering. 10,000-studerende er indskrevet på skolens 16-skoler, mens næsten 8,000-studerende er indskrevet på de tre kandidatskoler. Instituttet har fem primære campuser i Sendai City, og programmerne drejer sig om landbrug, videnskab, teknik og medicin discipliner. Noterbare alumner omfatter forfatterne Ben Goto og Lu Xun.
2. Kyoto Universitetet -
Kyoto Universitet blev rangeret andet af Times Higher Education blandt landets universiteter, og det er det næst ældste universitet i Japan. Kyoto Universitet blev til i 1897 som Kyoto Imperial University i Honshu Island. I begyndelsen tilbød universitetet programmer inden for ingeniørvidenskab, naturvidenskab, medicin, lov og bogstaver, og den har siden udvidet til at omfatte landbrug, økonomi, humaniora, arkæologi, uddannelse, klassiske studier og miljøstudier. Universitetets vigtigste universiteter er Yoshida, Katsura og Uji. Skolen ligger i den historiske by Kyoto, der byder på talrige gamle templer og det ikoniske Kyoto kejserpalads. Universitetets nuværende tilmelding er cirka 22,700 studerende. Instituttet har produceret adskillige nobelpristagere, heriblandt Susumu Tonegawa og Hideki Yukawa.
1. University of Tokyo -
University of Tokyo, et forskningsuniversitet, er centreret i Bunkyō Ward of Tokyo. Universitetet blev til i 1877, efter at Meiji-regeringen integrerede Tokyo Medical School og Kaisei School. Universitetsuddannelserne fokuserede på kinesiske klassikere, lov, vestlig medicin og videnskab. Over tid fusionerede universitetet med andre forskellige skoler og udvidede antallet af discipliner, der læres at omfatte landbrug, ingeniørarbejde, astronomi, fysik, kunst, uddannelse og økonomi. Universitetet er opdelt i tre primære campusser, nemlig Hongo, Kashiwa og Komaba campusser, med andre faciliteter spredt ud over hele landet. Universitetet klassificeres ofte som det bedste i hele Asien, og dets tilmelding er estimeret til 30,000-studerende. Skolen har produceret flere af Japans premierministre, herunder Kiichi Miyazawa, der tjente fra 1991 til 1993, og Takeo Fukuda, som var på kontoret fra 1976 til 1978.