
Somalia har et varmt og tørt klima over de fleste dele af landet, selvom nedbør og vinden kan være meget variabel på steder på bestemte tider af året. Klimaændring forekommer sjældent på grund af somalisk nærhed til ækvator. Northern Somali er en maritim semi-ørken dækket af buske, små buske og græsklumper og lavvandede vandløb. Denne region er en del af det etiopiske xeric græsareal og shrublands økosystem. Den nordlige, nordøstlige og nord-centrale vegetation består af de spredte træer af akacia og græsplækker. Langs Det Indiske Ocean dominerer Hobyo græsarealer og busk økosystem med spredte skrubber, græs klumper og kystnære klitter. De østafrikanske mangrover findes langs kysten fra Kismaayo til den kenyanske grænse. Nedenfor kortes økosystemerne i Somalia.
Østafrikanske mangrover
Økegionen består af mangrove sumpere, der ligger nær kysten af Østafrikas kystlinjer i Det Indiske Ocean. Øko-regionen er delt mellem Kenya, Tanzania, Sydlige Somalia og Mozambique. Disse kystområder oplever to monsun årstider hvert år præget af stigende hav og stærke havstrømme i Mozambique og høje regnfald i det nordlige Tanzania og det sydlige Kenya. De østafrikanske mangrove skove hører til biomet af tropiske og subtropiske fugtige bredbladede skove.
Økosystemets flora omfatter mange høje træer, der stiger til 30 meter eller højere. Vegetationen består stort set af to typer, nemlig mangrove, der fodres af flodinløb, hvor salt ophobes, og mangroverne fodres af ferskvands floder på kysten af Watamu og Lamu i Kenya. En bred vifte af dyreliv beboer mangroverne, fra Sykes Monkeys, antiloper. Afrikanske bøffel og elefanter græsning på sumpen frynser til fisk, krebsdyr og bløddyr findes i vandet. The Hawksbill skildpadder, oliven ridley, grøn skildpadde og flodhest feed i sumpene. Økosystemet er hjemsted for en forskelligartet flora og fauna. Korallerne beskytter økosystemet mod havets tidevand og storme, der giver vigtige fodringspladser til trækfugle, såsom krøllespand og lille stint, og vandfugle, herunder krabbeploveren og havfugle som rosenkornet.
I århundreder er mangroverne blevet høstet til tømmer, der skal sendes til den arabiske halvø og ryddes for at skabe rum til urbanisering og landbrug. Forurening af floder, der strækker sig ind i Det Indiske Ocean, og industriel og husholdningsaffald bortskaffelse langs kystområderne er problemer med økosystemet. Der er lidt information om beskyttede områder på den somaliske side. Men Kenya, Tanzania og Mozambique har afsat nogle områder som beskyttede zoner eller skove reserver.
Etiopiske Xeric Grasslands og Shrublands
Økosystemet er en semi-ørken stribe nær Rødehavet og langs Adenbugten i Etiopien, Eritrea og somalier. Topografien er præget af bakker og massiver, der stiger til 1300 meter og fejlinduserede fordybninger som Danakil, som ligger 155 meter under havets overflade. Området er aktivt tektonisk og oplever mange jordskælv og aktive vulkaner. Ekoregionen har et varmt og tørt klima. Regnen er ekstremt lav med et årsmængde på omkring 100 til 200 millimeter. Dragetræet er den primære flora af økegionen. Den Somali Wild Ass, Dorcas Gazelle, Beira, Beisa Oryx og Gerenuk udgør den dominerende fauna. Tørre levesteder, herunder gecko, er også almindelige. Politisk ustabilitet er det største problem for økosystemets biodiversitet og overlevelse. Den nomadiske livsstil bidrager også til miljøforringelse, og regeringerne i disse regioner har få regler, og beskyttelsesforanstaltninger findes kun på etiopisk side.
Northern Zanzibar-Inhambane Kystskovsmosaik
Økosystemet er en del af den tropiske fugtige bredbladede skovbiom i den østafrikanske kyst, der danner den sydlige del af Somalia. Økosystemet består af savanne, skove og sump. Mod nord er der tørre og åbne skove og buskmarker, mod øst er Det Indiske Ocean, norden udgøres af de somaliske Acacia-Commiphora Bushlands og Thickets, østlige Miombo skovområder mod sydvest. Økosystemet er hjemsted for endemiske fuglearter som Treron og Otus-arter på øen Pemba. Nogle arter findes også på fastlandet Kenya langs floden Tana og kystområderne.
Somaliske Montane Xeric Woodlands
Dette økosystem løber over Afrikas Horn. Det indeholder rester af plantearter fra Macaronesian, Middelhavet og Afromontane regioner. Området modtager det højeste regnfald i Somali. Naturens fauna og flora er forholdsvis stabile på grund af lav menneskelig indbrud takket være de fjerne skarpe og plateauområder, selvom jagt større dyr har reduceret deres befolkning. Strenge endemiske krybdyr i området omfatter spalerosophis og Leptotyphlops slanger og pseudememier firbenet. Den Somaliske Pigeon og Trusser findes i de nordlige Somaliske Bjerge. Gazellerne er mere udbredt end andre pattedyr, men lider af overjagt og overgravning af husdyr. Den biologiske værdi af det meste af økosystemet i Somalien er ukendt. År med politisk ustabilitet i landet gør tilgængelighed og studier vanskelige. Oplysningerne om økosystemets biodiversitet er gamle og potentielt upålidelige på grund af klimaændring, urbanisering, civilisation og andre menneskelige aktiviteter og naturfænomener.
Økologiske regioner i Somalia
| Økologiske regioner i Somalia (som pr. Verdensfonde for Natur) | Biome |
| Etiopiske Montane Skove | Tropiske og subtropiske fugtige bredbladede skove |
| Østafrikanske mangrover | Mangroves |
| Etiopiske Xeric Grasslands og Shrublands | Ørkener og Xeric Shrublands |
| Hobyo Grasslands and Shrublands | Ørkener og Xeric Shrublands |
| Northern Zanzibar-Inhambane Kystskovsmosaik | Tropiske og subtropiske fugtige bredbladede skove |
| Somali Acacia-Commiphora Bushlands og Thickets | Tropiske og subtropiske græsarealer, Savannas og Shrublands |
| Somaliske Montane Xeric Woodlands | Ørkener og Xeric Shrublands |