Indonesien er beliggende i Sydøstasien, og er et af verdens største arkipelagiske lande. Nationen består af over 13,000 øer, der dækker et samlet område på over 0.735 millioner kvadrat miles. På trods af at være anerkendt som en ø nation, har Indonesien en landsgrænse på 1,924 miles i længden. Landet deler sin landegrænse med tre lande i Østtimor (157 miles), Papua Ny Guinea (512 miles) og Malaysia (1,255 miles). Indonesien har også en lang maritim grænse, som den deler med Indien, Australien, Thailand, Vietnam, Palau, Singapore og Filippinerne.
Papua Ny Guinea
Indonesien og Papua Ny Guinea deler en landgrænse. Grænsen mellem de to lande skærer på tværs af øen New Guinea og er 510 miles lang. Grænsen følger en lige linje og løber fra nord til syd for øen. Grænsen starter fra Stillehavskysten og løber sydpå til slutningen ved Arafurahavet. Indonesiens provinser West Papua og Papua findes langs grænsen. Den internationale grænse blev først fastslået, mens de to nationer var under den britiske og hollandske koloniale administration i 19th Century.
De to lande havde i mange år beskæftiget sig med territoriale tvister, som de havde løst efter undertegnelsen af en traktat i 1979. De indonesiske forsvarsstyrker har fået indfald over grænsen til et par gange til Papua Ny Guinea. Ikke desto mindre er begge lande enige om, at det er vigtigt at have en sikker grænse for de to nabolandes gensidige økonomiske fordel. Blandt de travleste grænseovergange på grænsen mellem Papua Ny Guinea og Indonesien er den på Wutung. Grænsekrydset bruges af tusindvis af mennesker fra Papua Ny Guinea for at få adgang til de billige råvarer, der er tilgængelige på Bhatas markeder i Indonesien.
Grensen er porøs med grænseoverskridende bevægelser, der for det meste er ureguleret af myndighederne. Selvom manglen på ordentlig grænsekontrol hjælper med at forbinde stammedyr, der findes på modsatte sider af grænsen, udsætter dette også begge lande for sikkerhedsbrud. Problemet forværres yderligere af tilstedeværelsen af en secessionistbevægelse. Den porøse grænse har været hovedpine for bevarende, der hævder, at ulovlige skovbrugere udnytter manglen på grænsekontrol til at smugle tømmer, der har alvorligt ramt skovdækslet i New Guinea.
Østtimor
Indonesien deler en landegrænse med Østtimor på øen Timor. Grænsen mellem de to lande er den korteste landegrænse, som Indonesien deler med et andet land, der strækker 157 miles i længden. Den internationale grænse blev først defineret i 1915 af nederlandsk og portugisisk, som havde påberåbt sig øen Timor. Indonesien ville bevare grænsen efter at have opnået uafhængighed fra hollandsk. Men grænsen beviste den blodige borgerkrig, der pitterede to politiske grupper i Østtimor, da landet kæmpede for uafhængighed fra Portugal i 1970'erne.
Malaysia
Et andet land, som Indonesien deler en landgrænse med, er Malaysia. Den internationale grænse, der afgrænser de to nationer, ligger på øen Borneo. Begyndende ved Tanjung Datu, grænsen kører 1,255 miles i længden sluttende ved Sebatikbugten. Grænsen rører tre indonesiske provinser af vest, nord og øst kalimantan. I Malaysia rammer grænsen to stater i Sarawak og Sabah.
Grænsen afgrænser Malaysia og Indonesien blev først bestemt i 1891, da de to lande var henholdsvis nederlandske og britiske kolonier. Grænsen blev defineret i grænsekonventionen undertegnet i juni 20th, 1891 i London. De to koloniale magter ville senere blive enige om at finjustere grænsen i det tidlige 20th Century. Både Malaysia og Indonesien ville bevare grænsen som etableret af kolonimagten, efter at de to lande blev uafhængige. De to lande ville imidlertid senere engagere sig i territoriale tvister over afgrænsningen af den internationale grænse. Indonesien og Malaysia enedes endelig om at gennemføre en fælles mellemstatslig undersøgelse om grænsen i november 1973, som startede i 1975 og sluttede i 2000.
Der er adskillige grænseovergange fundet langs grænsen. Grænsen har kun tre officielle grænseovergange, hvor grænsemyndigheder kontrollerer grænseoverskridende bevægelser. Disse officielle grænseovergange er Badau-Lubok Antu-krydset, Aruk-Biawak-krydset og Entikong-Tebedu-krydset. Men disse officielle grænseovergange er uanset grænsen porøs og oplever tusindvis af ulovlige krydsninger hver dag. Nogle punkter på grænsen oplever så mange ulovlige krydsninger, at de betragtes som uformelle grænseovergange.
Maritime grænser
Udover at dele en landgrænse med Indonesien deler Malaysia også en lang søfartsområde med sit nabolande. De to lande har maritime grænser i det sydkinesiske hav, Singapores, Melakas og Celebeshavet. Den maritime grænse har mere end 20 officielle søtransport, som letter grænseoverskridende bevægelser mellem nabolandene. Havgrænsen blev etableret efter undertegnelsen af en lang række internationale traktater i løbet af det 20 århundrede. Men kun grænsen afgrænser de to lande i Sydkinesiske Hav er blevet defineret og accepteret af begge nationer. Som følge heraf findes der territoriale tvister, især i Celebeshavet, hvor de to lande har påberåbt sig både Ambalat-blokken og Sipadan og Ligitan-øerne.
Blandt de lande, som Indonesien deler en maritim grænse med, er Vietnam. Den maritime grænse afgrænser de territoriale påstande, som de to lande har i Sydkinesiske Hav. Grænsen blev defineret i en aftale de to lande underskrev i 2003 i Hanoi. Ifølge aftalen er grænsen (kendt som kontinentalsokkelfranden) defineret som en imaginær linje fundet mellem to punkter.
