Guinea-Bissaus borgerkrig opslukkede det vestafrikanske land Guinea-Bissau mellem juni 7th, 1998 og May 10th, 1999. Ansumane Mane, landets tidligere stabschef, som blev suspenderet af præsident Vieira for angiveligt at vække en separatistisk bevægelse, førte til et militært oprør mod regeringen, der udløste krigen. Et anslået 655-folk blev dræbt under borgerkrigen, og mere end 0.35 millioner blev fordrevet. Borgerkrigen sluttede, efter at begge krigende fraktioner ophørte med ild og etablerede en regering af national enhed, en som var kortvarig.
Baggrund
Præsident Vieira og Ansumane Mane havde en lang historie om samarbejde. De to var centrale figurer i landets kamp for uafhængighed fra Portugal. Et militært kup af 1980 gjorde det muligt for Vieira at komme op til formandskabet, mens Mane støttede ham. Som præsident udpegede Vieira Mane som stabschef, en stilling, som sidstnævnte havde indtil sin suspension i 1998. I måneder forud for borgerkrigen var Guinea-Bissau i krig mod en gruppe af separatister fra landets Casamance-region. Militæret var blevet deployeret i regionen for at indeholde separatisterne, men snart erkendte regeringen, at højtstående militærofficerer leverede separatisterne med våben. Denne forbløffende åbenbaring førte til suspensionen af Ansumane Mane i februar 1998.
Den væbnede konflikt
Valg i maj 1998 så Vieira tilbage som sit formand som formand og blandt hans første handlinger var udskiftningen af Mane som stabschef med Humberto Gomes. Mane tog ikke sin afskedigelse let og sammen med en gruppe væbnede styrker, overtog kontrollen over Bissaus internationale lufthavn og militære kaserne i landets hovedstad i juni 7th, der markerede starten på Guinea-Bissaus borgerkrig. Regeringsstyrker støttet af tropper fra Senegal og Guinea kæmpede voldsomt mod de oprørskræfter, som i slutningen af 1998 var i kontrol over det meste af landet. Interventioner fra det internationale samfund var med til at indlede fredsforhandlinger mellem de krigende parter. Efter mange uoverensstemmelser meddelte Vieira og Mane oprettelsen af en nationalt enhedsregering i februar 9th, 1999. Den forenede regering var kortvarig som en militærjunta i maj 7th deponeret præsident Vieira og overgav senere i maj 10th. Mane havde en stilling som formanden for Junta, som effektivt gjorde ham til Guinea-Bissaus statschef, omend i en kort periode, der varede fra maj 7th til maj 14th.